El aguacate (Persea americana Mill.) es una especie frutal de alto valor económico cuya producción está amenazada por diversos hongos fitopatógenos, entre ellos Fusarium sp. En esta tesis se evaluó de manera integral el papel de dos clases de ARN no codificantes (ncRNAS), losmicroRNAs (miRNAs) y los RNAS largos no codificantes (IncRNAs), en la respuesta transcripcional de P. americana var. drymifolia frente a la infección radicular provocada por lacepa INECOL_BM-06 de Fusarium sp. Para ello, se integraron bibliotecas de RNA-seq paraRNAm y RNAs pequeños junto con una versión mejorada del ensamblado del genoma de lavariedad drymifolia. Estas mejoras, que permitieron ensamblar el genoma a nivel depseudomoléculas, se realizaron utilizando como referencia el mapa genético del cultivar Hass. Se identificaron miRNAs conservados y nuevos miRNAs putativos expresados diferencialmente a lo largo del proceso infeccioso, cuyos genes blancos están implicados en rutas clave como la señalización hormonal (ácido jasmónico, etileno y ácido abscísico), metabolismo de especies reactivas de oxígeno (ROS), expresión de genes de resistencia (R genes) y remodelación de la pared celular. De forma complementaria, se realizó la predicción y caracterización funcional de IncRNAs, identificando aquellos cuya expresión se altera en respuesta a la infección, asi como su potencial para actuar como precursores de miRNAs o como elementos señuelo que modulan su actividad. Uno de los hallazgos más relevantes fue la identificación de una red reguladora miRNA-IncRNA-mRNA activa en momentos específicos del proceso infeccioso, lo cual sugiere que estos ncRNAs participan de forma coordinada en la reprogramación transcripcional de defensa. Cabe destacar que, aunque se ha avanzado en el estudio de los miRNAs en plantas, el conocimiento funcional de los IncRNAs en contextos de respuesta a patógenos es aún incipiente. Este trabajo constituye una de las primeras aproximaciones sistemáticas al análisis de IncRNAs en defensa vegetal en una especie del clado Magnolídas, aportando evidencia novedosa sobre su papel en la inmunidad basal y destacando la relevancia de los ncRNAs en especies vegetales no modelo.

Consulta esta tesis en la clasificación: TDD20250008

Forma sugerida para citar

• Pale Rivas, Michel. (2025). Caracterización de RNAs no codificantes responsivos a la infección de Fusarium sp. en aguacate (Persea americana var. drymifolia) [Tesis de Doctorado]. Instituto de Ecología, A.C.